蚩尤帶領著九黎部落偷襲了中原的神農氏部落，掠奪了大量的財富。他並沒有停止侵略的步伐，很快就要進攻軒轅氏了。

  軒轅一邊召集軒轅、神農兩氏氏族長老商議，一邊派出先遣部隊試探蚩尤的實力，結果三戰三敗。軒轅大驚，大夥都說我們的武器根本傷不到他們。軒轅憂心忡忡，尋思應對銅頭鐵臂之策。這時，眾長老都推薦風後有經天緯地之才，應請他出山輔佐。於是軒轅四處尋訪，終於在海隅找到了風後。軒轅搭建了高台，在其上祭祀祈禱，封拜風後為宰相，處理部落諸事。封台拜相剛結束，一隻無角而生有雙翅的龍飛到現場，說道：“我是應龍，昊天上帝知黃帝有難，特遣我下凡助黃帝一臂之力。”眾人歡呼，喜悅之情溢於言表。軒轅又封力牧和常先為將軍，負責訓練士卒，操練兵馬。力牧力大無窮，常先則發明了鼓，敲打起來能鼓舞戰士們的士氣。

  風後對軒轅道：“九天玄女有一部兵法，變幻莫測，奧妙無窮，要是能夠習得此兵法，請九天玄女幫助，事情已成功一半了。”軒轅問：“能請到九天玄女甚好，那如何能請到玄女相助呢？”風後答道：“九天玄女乃是昊天上帝之女，掌管兵法，為正義之神。要想請來九天玄女，請黃帝先沐浴齋戒三天，心地澄明，虔心禱告。”軒轅照著風後的方法，果然第三天九天玄女降臨，授予軒轅兵法、兵符，傳授軍陣。傳授完畢，又贈軒轅一把昆吾劍，然後升天而去。這把昆吾劍，削鐵如泥，正好能對付蚩尤兄弟的銅頭鐵臂。又因軒轅隨身佩帶此劍，後人又稱這把劍為軒轅寶劍。

  中原部落炎黃聯軍和蚩尤率領的九黎部落相遇於涿鹿之野。蚩尤見炎黃聯軍武器裝備雖不及九黎部落軍隊，但陣容齊整、軍紀嚴明，心中暗暗吃驚，炎黃陣中必有高人。兩軍交戰，九黎部族並未占上風。炎黃聯軍陣型千變萬化、演變嫻熟，九黎部落疲於應對。正在兩軍膠著之時，軒轅將平時馴養的熊、羆、貔、貅、貙、虎，趕上戰場，九黎部落猝不及防，敗退下來。

  接著，蚩尤召集了一支由魑、魅、魍、魎組成的大軍，向炎黃聯軍殺奔而來。這些魑、魅、魍、魎，原來活動在山林沼澤之間，有些是自然形成的鬼怪，有些是機靈老道的精怪，專門害人吃人。不知蚩尤用了什麽方法，將它們招來。炎黃聯軍的士兵見到魑、魅、魍、魎都嚇破了膽，哪裏還想到戰鬥；連馴養的野獸，都被嚇得掉頭就跑。於是炎黃聯軍大敗而回。

  軒轅更為憂慮，和風後商討對策。風後道：“今天我們遇到的是魑、魅、魍、魎，原本隻在山林沼澤中害人，不想蚩尤能把它們召喚到涿鹿草原上來。不過主公不必擔心，魑、魅、魍、魎都有一個共同弱點，就是害怕雷聲。”軒轅道：“難道我們要把雷神請下來？”風後道：“這可不必，隻需如此如此，這般這般。”軒轅微微一笑，命令常先率領一支人馬到流波山上捕捉夔，剝下夔皮；又命令力牧率領另一支人馬深入雷澤，找到雷神，趁著雷神睡覺時，大夥一擁而上，砍下雷神的一隻龍腿。力牧和常先回到部落，常先用獲得的夔皮製成五十麵戰鼓，又用雷神的腿骨做成鼓槌。用雷神鼓槌去敲擊夔鼓，發出的聲音就像打雷一樣。

  炎黃聯軍和九黎部落再次交鋒，隻等魑、魅、魍、魎靠近，炎黃聯軍敲起五十麵夔鼓，頓時雷聲大作，這次是魑、魅、魍、魎嚇得掉頭就跑。炎黃聯軍一邊追擊一邊敲鼓，九黎部落大敗。應龍也飛著追殺過來，在他身下是一堆魑、魅、魍、魎的屍體。其餘幸存的魑、魅、魍、魎逃回到山林沼澤中去，再也不敢出來了。

  蚩尤敗了一陣，命令九黎部落所有祭師一起作法，興起濃厚的迷霧。炎黃聯軍被重重迷霧包圍，九黎部落趁機衝殺過去。炎黃聯軍陣型被衝亂，被九黎部落趕進樹林，再逐個擊殺，再加上濃霧彌漫，不辨方向，還常常自相殘殺。眼看炎黃聯軍就要潰敗時，風後駕駛自己發明的指南車而來，重新召集軍隊，指引方向，殺出了迷霧重圍。蚩尤的謀略再次被挫敗。

  蚩尤不甘心失敗，於是請來風伯和雨師。風伯名叫飛廉，長著鹿一樣的身子，布滿豹的花紋，有像孔雀的頭，頭上長著奇怪的角，他吹出來的風能把巨大的石塊吹走。雨師名叫萍翳，形象像一隻鳥，能大能小，他降下的雨水能夠淹沒村莊和莊稼。炎黃聯軍遭到了強烈的****，士兵苦不堪言。應龍趕來，張開大嘴，吸進風雨。風伯和雨師一見，加大法力，召喚出更大的風雨，應龍在這樣的狂風驟雨下身體搖搖晃晃，支撐不住，急忙逃開。炎黃聯軍又敗了一場。

  眾人震驚於連應龍都無法對付風伯和雨師，正一籌莫展之時，從西北天空上降下一名女子，軒轅定睛一看，不禁喜從心來。原來是軒轅的女兒，旱神女魃。女魃所到之處，必定大旱。女魃一到戰場，風雨頓時消失。風伯和雨師見自己法術被破，急忙逃走。炎黃聯軍趁機出擊，攻入九黎部落大本營，將蚩尤生擒。

  軒轅黃帝曆數蚩尤殘暴殺戮之罪，然後提起昆吾劍，將蚩尤頭顱砍下。蚩尤怨氣猶存，軒轅害怕蚩尤複生，將蚩尤的頭顱和身體分別葬在不同的地方。埋葬蚩尤頭顱的地方長出一片血楓林，這些楓樹的葉子是被蚩尤頭顱的血染紅的。而蚩尤身體埋在一座大山下，蚩尤身體的鮮血將大山下的一整座鹽池染紅。

  蚩尤死後，九黎部落一小部分人向中原部落投降，大部分人和東夷部落融合，還有一小部分逃到南方，形成苗蠻部落。

  蚩尤死後，許多九黎部落的人仍不服氣，想要和軒轅繼續鬥爭。軒轅黃帝封蚩尤為“兵主”，蚩尤的怨氣被安撫。軒轅又將蚩尤的畫像畫在戰旗上，四處巡走，那些不服氣的殘餘勢力見到蚩尤旗，便不再作亂。

  涿鹿之戰之慘烈，是以前從未有過的。交戰雙方都幾乎動用了部落的全部資源。而應龍和女魃，則因為在戰爭中消耗太大，不能回到天上。女魃所在的地方，常年幹旱少雨；而應龍棲息的地方，則常年濕潤多雨。